Protein–RNA interactions for Protein: Q14590

ZNF235, Zinc finger protein 235, humanhuman

Predictions only

Length 738 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF235Q14590 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF235Q14590 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF235Q14590 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF235Q14590 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF235Q14590 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF235Q14590 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF235Q14590 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF235Q14590 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF235Q14590 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF235Q14590 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF235Q14590 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF235Q14590 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF235Q14590 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF235Q14590 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF235Q14590 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF235Q14590 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF235Q14590 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF235Q14590 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF235Q14590 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF235Q14590 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZNF235Q14590 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF235Q14590 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF235Q14590 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF235Q14590 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF235Q14590 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF235Q14590 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF235Q14590 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF235Q14590 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF235Q14590 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF235Q14590 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF235Q14590 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF235Q14590 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF235Q14590 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF235Q14590 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF235Q14590 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF235Q14590 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF235Q14590 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF235Q14590 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF235Q14590 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF235Q14590 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF235Q14590 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF235Q14590 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF235Q14590 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF235Q14590 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZNF235Q14590 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ZNF235Q14590 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
ZNF235Q14590 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF235Q14590 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF235Q14590 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF235Q14590 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF235Q14590 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF235Q14590 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF235Q14590 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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ZNF235Q14590 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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ZNF235Q14590 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
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ZNF235Q14590 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF235Q14590 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF235Q14590 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF235Q14590 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZNF235Q14590 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
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ZNF235Q14590 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF235Q14590 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF235Q14590 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF235Q14590 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF235Q14590 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF235Q14590 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF235Q14590 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF235Q14590 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF235Q14590 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF235Q14590 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF235Q14590 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF235Q14590 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF235Q14590 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF235Q14590 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF235Q14590 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF235Q14590 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZNF235Q14590 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF235Q14590 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF235Q14590 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF235Q14590 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF235Q14590 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF235Q14590 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF235Q14590 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF235Q14590 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF235Q14590 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF235Q14590 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF235Q14590 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF235Q14590 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZNF235Q14590 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
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