Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE1CQ14123 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE1CQ14123 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE1CQ14123 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE1CQ14123 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PDE1CQ14123 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PDE1CQ14123 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PDE1CQ14123 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PDE1CQ14123 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PDE1CQ14123 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
PDE1CQ14123 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PDE1CQ14123 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDE1CQ14123 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
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