Protein–RNA interactions for Protein: Q14011

CIRBP, Cold-inducible RNA-binding protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBPQ14011 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
CIRBPQ14011 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
CIRBPQ14011 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
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