Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
EXOSC2Q13868 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
EXOSC2Q13868 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
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