Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
APOFQ13790 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOFQ13790 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOFQ13790 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOFQ13790 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
APOFQ13790 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOFQ13790 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOFQ13790 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOFQ13790 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOFQ13790 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOFQ13790 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOFQ13790 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOFQ13790 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOFQ13790 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
APOFQ13790 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOFQ13790 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOFQ13790 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOFQ13790 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOFQ13790 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOFQ13790 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOFQ13790 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
APOFQ13790 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOFQ13790 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOFQ13790 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOFQ13790 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOFQ13790 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOFQ13790 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOFQ13790 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOFQ13790 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOFQ13790 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOFQ13790 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOFQ13790 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
APOFQ13790 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOFQ13790 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOFQ13790 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOFQ13790 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOFQ13790 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOFQ13790 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOFQ13790 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOFQ13790 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOFQ13790 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOFQ13790 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOFQ13790 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOFQ13790 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOFQ13790 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOFQ13790 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
APOFQ13790 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOFQ13790 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOFQ13790 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOFQ13790 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOFQ13790 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOFQ13790 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOFQ13790 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOFQ13790 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOFQ13790 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOFQ13790 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOFQ13790 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOFQ13790 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOFQ13790 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
APOFQ13790 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOFQ13790 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOFQ13790 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOFQ13790 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOFQ13790 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOFQ13790 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOFQ13790 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOFQ13790 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOFQ13790 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOFQ13790 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOFQ13790 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOFQ13790 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOFQ13790 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOFQ13790 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOFQ13790 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
APOFQ13790 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOFQ13790 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOFQ13790 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOFQ13790 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOFQ13790 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOFQ13790 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
APOFQ13790 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOFQ13790 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOFQ13790 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOFQ13790 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOFQ13790 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOFQ13790 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOFQ13790 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOFQ13790 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOFQ13790 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOFQ13790 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOFQ13790 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOFQ13790 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOFQ13790 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOFQ13790 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOFQ13790 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOFQ13790 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOFQ13790 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOFQ13790 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOFQ13790 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOFQ13790 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
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