Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SF3B2Q13435 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SF3B2Q13435 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SF3B2Q13435 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SF3B2Q13435 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SF3B2Q13435 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SF3B2Q13435 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SF3B2Q13435 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SF3B2Q13435 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SF3B2Q13435 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SF3B2Q13435 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SF3B2Q13435 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SF3B2Q13435 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SF3B2Q13435 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SF3B2Q13435 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SF3B2Q13435 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SF3B2Q13435 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SF3B2Q13435 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SF3B2Q13435 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SF3B2Q13435 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SF3B2Q13435 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SF3B2Q13435 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SF3B2Q13435 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SF3B2Q13435 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SF3B2Q13435 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SF3B2Q13435 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SF3B2Q13435 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SF3B2Q13435 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SF3B2Q13435 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SF3B2Q13435 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SF3B2Q13435 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SF3B2Q13435 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SF3B2Q13435 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SF3B2Q13435 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SF3B2Q13435 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
SF3B2Q13435 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SF3B2Q13435 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SF3B2Q13435 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SF3B2Q13435 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SF3B2Q13435 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SF3B2Q13435 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SF3B2Q13435 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SF3B2Q13435 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SF3B2Q13435 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SF3B2Q13435 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
SF3B2Q13435 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SF3B2Q13435 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SF3B2Q13435 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SF3B2Q13435 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SF3B2Q13435 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SF3B2Q13435 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SF3B2Q13435 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
SF3B2Q13435 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SF3B2Q13435 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SF3B2Q13435 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SF3B2Q13435 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SF3B2Q13435 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SF3B2Q13435 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SF3B2Q13435 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SF3B2Q13435 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SF3B2Q13435 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SF3B2Q13435 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SF3B2Q13435 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SF3B2Q13435 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SF3B2Q13435 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
SF3B2Q13435 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SF3B2Q13435 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SF3B2Q13435 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SF3B2Q13435 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SF3B2Q13435 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SF3B2Q13435 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SF3B2Q13435 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SF3B2Q13435 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SF3B2Q13435 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SF3B2Q13435 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SF3B2Q13435 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SF3B2Q13435 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SF3B2Q13435 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SF3B2Q13435 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SF3B2Q13435 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SF3B2Q13435 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SF3B2Q13435 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SF3B2Q13435 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SF3B2Q13435 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SF3B2Q13435 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SF3B2Q13435 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SF3B2Q13435 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SF3B2Q13435 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SF3B2Q13435 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SF3B2Q13435 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SF3B2Q13435 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SF3B2Q13435 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SF3B2Q13435 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SF3B2Q13435 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SF3B2Q13435 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SF3B2Q13435 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SF3B2Q13435 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SF3B2Q13435 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SF3B2Q13435 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SF3B2Q13435 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
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