Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 ADAM3B-201ENST00000569937 840 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
MKRN4PQ13434 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 COA4-204ENST00000541455 1038 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 AC007386.2-202ENST00000622718 1018 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MKRN4PQ13434 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
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