Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
RIGQ13278 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RIGQ13278 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RIGQ13278 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RIGQ13278 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RIGQ13278 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
RIGQ13278 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RIGQ13278 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RIGQ13278 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RIGQ13278 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RIGQ13278 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RIGQ13278 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RIGQ13278 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
RIGQ13278 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RIGQ13278 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RIGQ13278 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RIGQ13278 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RIGQ13278 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
RIGQ13278 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RIGQ13278 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RIGQ13278 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RIGQ13278 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RIGQ13278 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RIGQ13278 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RIGQ13278 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RIGQ13278 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
RIGQ13278 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
RIGQ13278 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RIGQ13278 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RIGQ13278 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RIGQ13278 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RIGQ13278 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
RIGQ13278 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RIGQ13278 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RIGQ13278 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RIGQ13278 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RIGQ13278 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RIGQ13278 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RIGQ13278 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RIGQ13278 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RIGQ13278 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RIGQ13278 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RIGQ13278 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RIGQ13278 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RIGQ13278 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RIGQ13278 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RIGQ13278 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RIGQ13278 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RIGQ13278 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RIGQ13278 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RIGQ13278 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RIGQ13278 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RIGQ13278 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RIGQ13278 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
RIGQ13278 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RIGQ13278 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
RIGQ13278 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RIGQ13278 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
RIGQ13278 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RIGQ13278 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RIGQ13278 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RIGQ13278 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RIGQ13278 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RIGQ13278 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RIGQ13278 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RIGQ13278 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RIGQ13278 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RIGQ13278 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RIGQ13278 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RIGQ13278 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RIGQ13278 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RIGQ13278 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RIGQ13278 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RIGQ13278 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RIGQ13278 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RIGQ13278 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RIGQ13278 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RIGQ13278 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RIGQ13278 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RIGQ13278 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RIGQ13278 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RIGQ13278 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RIGQ13278 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RIGQ13278 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RIGQ13278 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RIGQ13278 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RIGQ13278 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RIGQ13278 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RIGQ13278 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RIGQ13278 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
RIGQ13278 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RIGQ13278 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RIGQ13278 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RIGQ13278 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
RIGQ13278 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
RIGQ13278 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RIGQ13278 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RIGQ13278 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RIGQ13278 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
RIGQ13278 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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