Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
IFT88Q13099 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IFT88Q13099 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IFT88Q13099 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IFT88Q13099 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IFT88Q13099 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IFT88Q13099 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IFT88Q13099 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IFT88Q13099 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IFT88Q13099 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IFT88Q13099 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IFT88Q13099 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IFT88Q13099 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IFT88Q13099 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IFT88Q13099 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
IFT88Q13099 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
IFT88Q13099 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IFT88Q13099 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IFT88Q13099 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IFT88Q13099 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IFT88Q13099 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IFT88Q13099 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IFT88Q13099 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IFT88Q13099 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IFT88Q13099 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IFT88Q13099 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IFT88Q13099 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IFT88Q13099 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
IFT88Q13099 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
IFT88Q13099 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IFT88Q13099 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IFT88Q13099 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IFT88Q13099 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IFT88Q13099 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IFT88Q13099 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
IFT88Q13099 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IFT88Q13099 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
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IFT88Q13099 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
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IFT88Q13099 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
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IFT88Q13099 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IFT88Q13099 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IFT88Q13099 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
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IFT88Q13099 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
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IFT88Q13099 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IFT88Q13099 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IFT88Q13099 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
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IFT88Q13099 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFT88Q13099 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFT88Q13099 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
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IFT88Q13099 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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IFT88Q13099 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFT88Q13099 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
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IFT88Q13099 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFT88Q13099 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFT88Q13099 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFT88Q13099 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFT88Q13099 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFT88Q13099 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFT88Q13099 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFT88Q13099 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
IFT88Q13099 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFT88Q13099 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFT88Q13099 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFT88Q13099 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFT88Q13099 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFT88Q13099 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
IFT88Q13099 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFT88Q13099 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFT88Q13099 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
IFT88Q13099 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFT88Q13099 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFT88Q13099 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFT88Q13099 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFT88Q13099 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFT88Q13099 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFT88Q13099 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFT88Q13099 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
IFT88Q13099 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
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