Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
STRN3Q13033 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
STRN3Q13033 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms