Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GRIK3Q13003 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
GRIK3Q13003 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIK3Q13003 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIK3Q13003 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIK3Q13003 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIK3Q13003 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIK3Q13003 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIK3Q13003 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIK3Q13003 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIK3Q13003 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIK3Q13003 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIK3Q13003 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIK3Q13003 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIK3Q13003 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIK3Q13003 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIK3Q13003 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIK3Q13003 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIK3Q13003 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIK3Q13003 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIK3Q13003 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIK3Q13003 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GRIK3Q13003 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIK3Q13003 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIK3Q13003 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIK3Q13003 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIK3Q13003 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIK3Q13003 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIK3Q13003 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIK3Q13003 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIK3Q13003 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIK3Q13003 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIK3Q13003 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIK3Q13003 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIK3Q13003 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIK3Q13003 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIK3Q13003 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIK3Q13003 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIK3Q13003 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIK3Q13003 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIK3Q13003 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIK3Q13003 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GRIK3Q13003 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIK3Q13003 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIK3Q13003 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIK3Q13003 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIK3Q13003 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIK3Q13003 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIK3Q13003 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIK3Q13003 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIK3Q13003 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIK3Q13003 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIK3Q13003 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIK3Q13003 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIK3Q13003 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIK3Q13003 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIK3Q13003 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIK3Q13003 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIK3Q13003 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIK3Q13003 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIK3Q13003 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GRIK3Q13003 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIK3Q13003 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIK3Q13003 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIK3Q13003 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIK3Q13003 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIK3Q13003 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIK3Q13003 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIK3Q13003 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIK3Q13003 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIK3Q13003 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIK3Q13003 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIK3Q13003 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIK3Q13003 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GRIK3Q13003 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
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