Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CSTF3Q12996 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CSTF3Q12996 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
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