Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
FOXF1Q12946 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FOXF1Q12946 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms