Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RAB40BQ12829 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
RAB40BQ12829 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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RAB40BQ12829 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
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RAB40BQ12829 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB40BQ12829 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
RAB40BQ12829 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
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RAB40BQ12829 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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RAB40BQ12829 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RAB40BQ12829 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RAB40BQ12829 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
RAB40BQ12829 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
RAB40BQ12829 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
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