Protein–RNA interactions for Protein: Q12774

ARHGEF5, Rho guanine nucleotide exchange factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF5Q12774 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ARHGEF5Q12774 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ARHGEF5Q12774 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ARHGEF5Q12774 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ARHGEF5Q12774 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ARHGEF5Q12774 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
ARHGEF5Q12774 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ARHGEF5Q12774 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
ARHGEF5Q12774 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ARHGEF5Q12774 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ARHGEF5Q12774 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
ARHGEF5Q12774 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ARHGEF5Q12774 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ARHGEF5Q12774 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ARHGEF5Q12774 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ARHGEF5Q12774 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
ARHGEF5Q12774 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ARHGEF5Q12774 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ARHGEF5Q12774 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
ARHGEF5Q12774 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
ARHGEF5Q12774 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ARHGEF5Q12774 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ARHGEF5Q12774 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ARHGEF5Q12774 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ARHGEF5Q12774 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ARHGEF5Q12774 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ARHGEF5Q12774 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ARHGEF5Q12774 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ARHGEF5Q12774 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ARHGEF5Q12774 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ARHGEF5Q12774 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ARHGEF5Q12774 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
ARHGEF5Q12774 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ARHGEF5Q12774 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ARHGEF5Q12774 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ARHGEF5Q12774 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ARHGEF5Q12774 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ARHGEF5Q12774 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ARHGEF5Q12774 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ARHGEF5Q12774 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ARHGEF5Q12774 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ARHGEF5Q12774 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ARHGEF5Q12774 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ARHGEF5Q12774 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
ARHGEF5Q12774 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
ARHGEF5Q12774 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ARHGEF5Q12774 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ARHGEF5Q12774 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ARHGEF5Q12774 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ARHGEF5Q12774 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ARHGEF5Q12774 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ARHGEF5Q12774 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ARHGEF5Q12774 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ARHGEF5Q12774 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
ARHGEF5Q12774 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
ARHGEF5Q12774 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
ARHGEF5Q12774 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ARHGEF5Q12774 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ARHGEF5Q12774 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ARHGEF5Q12774 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
ARHGEF5Q12774 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ARHGEF5Q12774 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ARHGEF5Q12774 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
ARHGEF5Q12774 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ARHGEF5Q12774 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ARHGEF5Q12774 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
ARHGEF5Q12774 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
ARHGEF5Q12774 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
ARHGEF5Q12774 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ARHGEF5Q12774 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ARHGEF5Q12774 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ARHGEF5Q12774 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ARHGEF5Q12774 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ARHGEF5Q12774 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ARHGEF5Q12774 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ARHGEF5Q12774 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ARHGEF5Q12774 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ARHGEF5Q12774 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ARHGEF5Q12774 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
ARHGEF5Q12774 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
ARHGEF5Q12774 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
ARHGEF5Q12774 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
ARHGEF5Q12774 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ARHGEF5Q12774 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ARHGEF5Q12774 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ARHGEF5Q12774 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ARHGEF5Q12774 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ARHGEF5Q12774 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ARHGEF5Q12774 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ARHGEF5Q12774 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ARHGEF5Q12774 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ARHGEF5Q12774 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ARHGEF5Q12774 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
ARHGEF5Q12774 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ARHGEF5Q12774 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ARHGEF5Q12774 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ARHGEF5Q12774 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ARHGEF5Q12774 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ARHGEF5Q12774 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ARHGEF5Q12774 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
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