Protein–RNA interactions for Protein: Q12769

NUP160, Nuclear pore complex protein Nup160, humanhuman

Predictions only

Length 1,436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP160Q12769 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
NUP160Q12769 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
NUP160Q12769 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
NUP160Q12769 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
NUP160Q12769 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
NUP160Q12769 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
NUP160Q12769 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
NUP160Q12769 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
NUP160Q12769 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
NUP160Q12769 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
NUP160Q12769 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
NUP160Q12769 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
NUP160Q12769 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
NUP160Q12769 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
NUP160Q12769 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
NUP160Q12769 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
NUP160Q12769 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
NUP160Q12769 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
NUP160Q12769 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
NUP160Q12769 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
NUP160Q12769 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC32.17■■■□□ 2.74
NUP160Q12769 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
NUP160Q12769 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
NUP160Q12769 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
NUP160Q12769 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
NUP160Q12769 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
NUP160Q12769 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
NUP160Q12769 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
NUP160Q12769 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
NUP160Q12769 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
NUP160Q12769 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
NUP160Q12769 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
NUP160Q12769 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
NUP160Q12769 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
NUP160Q12769 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
NUP160Q12769 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
NUP160Q12769 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
NUP160Q12769 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NUP160Q12769 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
NUP160Q12769 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NUP160Q12769 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
NUP160Q12769 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
NUP160Q12769 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
NUP160Q12769 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NUP160Q12769 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NUP160Q12769 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
NUP160Q12769 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
NUP160Q12769 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
NUP160Q12769 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NUP160Q12769 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
NUP160Q12769 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
NUP160Q12769 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
NUP160Q12769 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
NUP160Q12769 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
NUP160Q12769 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC32.14■■■□□ 2.74
NUP160Q12769 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
NUP160Q12769 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
NUP160Q12769 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
NUP160Q12769 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC32.14■■■□□ 2.74
NUP160Q12769 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC32.14■■■□□ 2.74
NUP160Q12769 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC32.14■■■□□ 2.74
NUP160Q12769 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
NUP160Q12769 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
NUP160Q12769 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.73
NUP160Q12769 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
NUP160Q12769 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
NUP160Q12769 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
NUP160Q12769 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
NUP160Q12769 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
NUP160Q12769 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC32.13■■■□□ 2.73
NUP160Q12769 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
NUP160Q12769 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC32.13■■■□□ 2.73
NUP160Q12769 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
NUP160Q12769 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
NUP160Q12769 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
NUP160Q12769 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
NUP160Q12769 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
NUP160Q12769 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
NUP160Q12769 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
NUP160Q12769 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
NUP160Q12769 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
NUP160Q12769 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
NUP160Q12769 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
NUP160Q12769 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
NUP160Q12769 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
NUP160Q12769 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
NUP160Q12769 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
NUP160Q12769 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
NUP160Q12769 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
NUP160Q12769 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
NUP160Q12769 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
NUP160Q12769 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
NUP160Q12769 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.11■■■□□ 2.73
NUP160Q12769 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC32.11■■■□□ 2.73
NUP160Q12769 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
NUP160Q12769 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
NUP160Q12769 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
NUP160Q12769 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
NUP160Q12769 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
NUP160Q12769 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms