Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CPSF1Q10570 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CPSF1Q10570 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CPSF1Q10570 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CPSF1Q10570 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CPSF1Q10570 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CPSF1Q10570 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CPSF1Q10570 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CPSF1Q10570 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
CPSF1Q10570 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CPSF1Q10570 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CPSF1Q10570 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CPSF1Q10570 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CPSF1Q10570 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CPSF1Q10570 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CPSF1Q10570 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CPSF1Q10570 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CPSF1Q10570 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CPSF1Q10570 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CPSF1Q10570 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CPSF1Q10570 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CPSF1Q10570 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CPSF1Q10570 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CPSF1Q10570 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
CPSF1Q10570 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CPSF1Q10570 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CPSF1Q10570 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CPSF1Q10570 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CPSF1Q10570 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CPSF1Q10570 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CPSF1Q10570 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CPSF1Q10570 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CPSF1Q10570 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CPSF1Q10570 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CPSF1Q10570 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CPSF1Q10570 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CPSF1Q10570 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CPSF1Q10570 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CPSF1Q10570 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CPSF1Q10570 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CPSF1Q10570 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CPSF1Q10570 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CPSF1Q10570 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CPSF1Q10570 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CPSF1Q10570 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CPSF1Q10570 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CPSF1Q10570 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CPSF1Q10570 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CPSF1Q10570 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CPSF1Q10570 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CPSF1Q10570 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CPSF1Q10570 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
CPSF1Q10570 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CPSF1Q10570 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CPSF1Q10570 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CPSF1Q10570 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CPSF1Q10570 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CPSF1Q10570 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CPSF1Q10570 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CPSF1Q10570 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CPSF1Q10570 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CPSF1Q10570 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CPSF1Q10570 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CPSF1Q10570 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CPSF1Q10570 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CPSF1Q10570 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CPSF1Q10570 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CPSF1Q10570 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CPSF1Q10570 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CPSF1Q10570 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CPSF1Q10570 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CPSF1Q10570 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CPSF1Q10570 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CPSF1Q10570 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CPSF1Q10570 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CPSF1Q10570 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CPSF1Q10570 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CPSF1Q10570 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CPSF1Q10570 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CPSF1Q10570 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CPSF1Q10570 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CPSF1Q10570 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CPSF1Q10570 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CPSF1Q10570 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CPSF1Q10570 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CPSF1Q10570 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CPSF1Q10570 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CPSF1Q10570 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CPSF1Q10570 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CPSF1Q10570 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CPSF1Q10570 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CPSF1Q10570 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CPSF1Q10570 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CPSF1Q10570 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CPSF1Q10570 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CPSF1Q10570 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CPSF1Q10570 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CPSF1Q10570 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CPSF1Q10570 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CPSF1Q10570 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
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