Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAM2

RASGEF1B, Ras-GEF domain-containing family member 1B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1BQ0VAM2 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RASGEF1BQ0VAM2 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RASGEF1BQ0VAM2 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms