Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms