Protein–RNA interactions for Protein: Q08209

PPP3CA, Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP3CAQ08209 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPP3CAQ08209 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPP3CAQ08209 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPP3CAQ08209 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PPP3CAQ08209 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPP3CAQ08209 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPP3CAQ08209 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PPP3CAQ08209 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPP3CAQ08209 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PPP3CAQ08209 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPP3CAQ08209 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPP3CAQ08209 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPP3CAQ08209 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPP3CAQ08209 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPP3CAQ08209 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPP3CAQ08209 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPP3CAQ08209 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPP3CAQ08209 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPP3CAQ08209 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPP3CAQ08209 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPP3CAQ08209 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPP3CAQ08209 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPP3CAQ08209 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPP3CAQ08209 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PPP3CAQ08209 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPP3CAQ08209 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPP3CAQ08209 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPP3CAQ08209 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPP3CAQ08209 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPP3CAQ08209 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PPP3CAQ08209 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPP3CAQ08209 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPP3CAQ08209 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPP3CAQ08209 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPP3CAQ08209 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPP3CAQ08209 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPP3CAQ08209 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPP3CAQ08209 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPP3CAQ08209 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPP3CAQ08209 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPP3CAQ08209 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPP3CAQ08209 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPP3CAQ08209 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPP3CAQ08209 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPP3CAQ08209 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PPP3CAQ08209 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PPP3CAQ08209 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPP3CAQ08209 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPP3CAQ08209 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPP3CAQ08209 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPP3CAQ08209 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPP3CAQ08209 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPP3CAQ08209 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPP3CAQ08209 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPP3CAQ08209 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPP3CAQ08209 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPP3CAQ08209 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPP3CAQ08209 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPP3CAQ08209 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPP3CAQ08209 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PPP3CAQ08209 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPP3CAQ08209 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPP3CAQ08209 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPP3CAQ08209 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPP3CAQ08209 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPP3CAQ08209 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPP3CAQ08209 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPP3CAQ08209 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPP3CAQ08209 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPP3CAQ08209 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPP3CAQ08209 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPP3CAQ08209 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPP3CAQ08209 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPP3CAQ08209 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPP3CAQ08209 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPP3CAQ08209 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PPP3CAQ08209 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPP3CAQ08209 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPP3CAQ08209 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPP3CAQ08209 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPP3CAQ08209 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPP3CAQ08209 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPP3CAQ08209 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPP3CAQ08209 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPP3CAQ08209 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPP3CAQ08209 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPP3CAQ08209 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPP3CAQ08209 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPP3CAQ08209 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPP3CAQ08209 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PPP3CAQ08209 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPP3CAQ08209 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPP3CAQ08209 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PPP3CAQ08209 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPP3CAQ08209 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPP3CAQ08209 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPP3CAQ08209 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPP3CAQ08209 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPP3CAQ08209 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPP3CAQ08209 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms