Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP1-1Q07627 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP1-1Q07627 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP1-1Q07627 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP1-1Q07627 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP1-1Q07627 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP1-1Q07627 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP1-1Q07627 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP1-1Q07627 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP1-1Q07627 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP1-1Q07627 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP1-1Q07627 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP1-1Q07627 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP1-1Q07627 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP1-1Q07627 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP1-1Q07627 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP1-1Q07627 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP1-1Q07627 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP1-1Q07627 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP1-1Q07627 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP1-1Q07627 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP1-1Q07627 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP1-1Q07627 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
KRTAP1-1Q07627 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP1-1Q07627 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP1-1Q07627 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP1-1Q07627 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP1-1Q07627 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP1-1Q07627 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP1-1Q07627 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP1-1Q07627 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP1-1Q07627 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP1-1Q07627 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP1-1Q07627 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP1-1Q07627 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP1-1Q07627 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP1-1Q07627 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP1-1Q07627 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP1-1Q07627 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP1-1Q07627 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP1-1Q07627 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP1-1Q07627 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP1-1Q07627 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP1-1Q07627 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP1-1Q07627 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP1-1Q07627 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP1-1Q07627 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
KRTAP1-1Q07627 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRTAP1-1Q07627 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRTAP1-1Q07627 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRTAP1-1Q07627 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRTAP1-1Q07627 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRTAP1-1Q07627 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRTAP1-1Q07627 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRTAP1-1Q07627 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRTAP1-1Q07627 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRTAP1-1Q07627 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRTAP1-1Q07627 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRTAP1-1Q07627 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRTAP1-1Q07627 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRTAP1-1Q07627 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRTAP1-1Q07627 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KRTAP1-1Q07627 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRTAP1-1Q07627 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRTAP1-1Q07627 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KRTAP1-1Q07627 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRTAP1-1Q07627 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRTAP1-1Q07627 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KRTAP1-1Q07627 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRTAP1-1Q07627 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRTAP1-1Q07627 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRTAP1-1Q07627 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KRTAP1-1Q07627 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRTAP1-1Q07627 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRTAP1-1Q07627 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRTAP1-1Q07627 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
KRTAP1-1Q07627 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRTAP1-1Q07627 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRTAP1-1Q07627 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRTAP1-1Q07627 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
KRTAP1-1Q07627 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KRTAP1-1Q07627 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms