Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
UBE3AQ05086 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms