Protein–RNA interactions for Protein: Q03721

KCNC4, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC4Q03721 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNC4Q03721 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNC4Q03721 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNC4Q03721 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNC4Q03721 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNC4Q03721 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNC4Q03721 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNC4Q03721 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNC4Q03721 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNC4Q03721 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNC4Q03721 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNC4Q03721 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNC4Q03721 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNC4Q03721 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNC4Q03721 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNC4Q03721 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNC4Q03721 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNC4Q03721 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNC4Q03721 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNC4Q03721 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNC4Q03721 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNC4Q03721 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNC4Q03721 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNC4Q03721 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNC4Q03721 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNC4Q03721 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNC4Q03721 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNC4Q03721 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNC4Q03721 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNC4Q03721 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNC4Q03721 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
KCNC4Q03721 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNC4Q03721 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNC4Q03721 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNC4Q03721 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNC4Q03721 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNC4Q03721 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNC4Q03721 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNC4Q03721 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNC4Q03721 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNC4Q03721 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNC4Q03721 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNC4Q03721 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNC4Q03721 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNC4Q03721 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNC4Q03721 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNC4Q03721 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNC4Q03721 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNC4Q03721 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNC4Q03721 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNC4Q03721 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNC4Q03721 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNC4Q03721 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNC4Q03721 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNC4Q03721 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNC4Q03721 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNC4Q03721 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KCNC4Q03721 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
KCNC4Q03721 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.14■□□□□ 0.66
KCNC4Q03721 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
KCNC4Q03721 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
KCNC4Q03721 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
KCNC4Q03721 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
KCNC4Q03721 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms