Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
TOP2BQ02880 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
TOP2BQ02880 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
TOP2BQ02880 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
TOP2BQ02880 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
TOP2BQ02880 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
TOP2BQ02880 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
TOP2BQ02880 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
TOP2BQ02880 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
TOP2BQ02880 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
TOP2BQ02880 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
TOP2BQ02880 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
TOP2BQ02880 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
TOP2BQ02880 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
TOP2BQ02880 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
TOP2BQ02880 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
TOP2BQ02880 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
TOP2BQ02880 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
TOP2BQ02880 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
TOP2BQ02880 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
TOP2BQ02880 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
TOP2BQ02880 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
TOP2BQ02880 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.93
TOP2BQ02880 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.93
TOP2BQ02880 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.93
TOP2BQ02880 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.93
TOP2BQ02880 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.93
TOP2BQ02880 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC33.39■■■□□ 2.93
TOP2BQ02880 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
TOP2BQ02880 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
TOP2BQ02880 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
TOP2BQ02880 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
TOP2BQ02880 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
TOP2BQ02880 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
TOP2BQ02880 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
TOP2BQ02880 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
TOP2BQ02880 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
TOP2BQ02880 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
TOP2BQ02880 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
TOP2BQ02880 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
TOP2BQ02880 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
TOP2BQ02880 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
TOP2BQ02880 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
TOP2BQ02880 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
TOP2BQ02880 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
TOP2BQ02880 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
TOP2BQ02880 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
TOP2BQ02880 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
TOP2BQ02880 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
TOP2BQ02880 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
TOP2BQ02880 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
TOP2BQ02880 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
TOP2BQ02880 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
TOP2BQ02880 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
TOP2BQ02880 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
TOP2BQ02880 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
TOP2BQ02880 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC33.35■■■□□ 2.93
TOP2BQ02880 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
TOP2BQ02880 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
TOP2BQ02880 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
TOP2BQ02880 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
TOP2BQ02880 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
TOP2BQ02880 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
TOP2BQ02880 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
TOP2BQ02880 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
TOP2BQ02880 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
TOP2BQ02880 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
TOP2BQ02880 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
TOP2BQ02880 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC33.34■■■□□ 2.93
TOP2BQ02880 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
TOP2BQ02880 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
TOP2BQ02880 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
TOP2BQ02880 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
TOP2BQ02880 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
TOP2BQ02880 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
TOP2BQ02880 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
TOP2BQ02880 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
TOP2BQ02880 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
TOP2BQ02880 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
TOP2BQ02880 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
TOP2BQ02880 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
TOP2BQ02880 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
TOP2BQ02880 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
TOP2BQ02880 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
TOP2BQ02880 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
TOP2BQ02880 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
TOP2BQ02880 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
TOP2BQ02880 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
TOP2BQ02880 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
TOP2BQ02880 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
TOP2BQ02880 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.93
TOP2BQ02880 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.93
TOP2BQ02880 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
TOP2BQ02880 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
TOP2BQ02880 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
TOP2BQ02880 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
TOP2BQ02880 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
TOP2BQ02880 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC33.32■■■□□ 2.92
TOP2BQ02880 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC33.32■■■□□ 2.92
TOP2BQ02880 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms