Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HSF1Q00613 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HSF1Q00613 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms