Protein–RNA interactions for Protein: Q00169

PITPNA, Phosphatidylinositol transfer protein alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNAQ00169 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PITPNAQ00169 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms