Protein–RNA interactions for Protein: P80303

NUCB2, Nucleobindin-2, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB2P80303 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUCB2P80303 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUCB2P80303 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUCB2P80303 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NUCB2P80303 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUCB2P80303 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NUCB2P80303 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUCB2P80303 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUCB2P80303 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUCB2P80303 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUCB2P80303 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUCB2P80303 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUCB2P80303 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUCB2P80303 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUCB2P80303 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUCB2P80303 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NUCB2P80303 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUCB2P80303 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUCB2P80303 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUCB2P80303 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUCB2P80303 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUCB2P80303 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NUCB2P80303 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NUCB2P80303 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms