Protein–RNA interactions for Protein: P78312

FAM193A, Protein FAM193A, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM193AP78312 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM193AP78312 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM193AP78312 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM193AP78312 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM193AP78312 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM193AP78312 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM193AP78312 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM193AP78312 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM193AP78312 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM193AP78312 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FAM193AP78312 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM193AP78312 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM193AP78312 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM193AP78312 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM193AP78312 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM193AP78312 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM193AP78312 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM193AP78312 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM193AP78312 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM193AP78312 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM193AP78312 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM193AP78312 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM193AP78312 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM193AP78312 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM193AP78312 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM193AP78312 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM193AP78312 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM193AP78312 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM193AP78312 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM193AP78312 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM193AP78312 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM193AP78312 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM193AP78312 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM193AP78312 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FAM193AP78312 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
FAM193AP78312 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
FAM193AP78312 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
FAM193AP78312 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FAM193AP78312 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms