Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPL23P62829 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPL23P62829 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPL23P62829 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPL23P62829 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPL23P62829 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPL23P62829 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPL23P62829 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPL23P62829 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPL23P62829 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RPL23P62829 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RPL23P62829 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RPL23P62829 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RPL23P62829 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RPL23P62829 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RPL23P62829 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RPL23P62829 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RPL23P62829 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RPL23P62829 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RPL23P62829 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RPL23P62829 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RPL23P62829 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RPL23P62829 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RPL23P62829 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RPL23P62829 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RPL23P62829 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RPL23P62829 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RPL23P62829 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL23P62829 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL23P62829 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL23P62829 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL23P62829 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL23P62829 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL23P62829 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL23P62829 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL23P62829 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL23P62829 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL23P62829 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL23P62829 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL23P62829 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL23P62829 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL23P62829 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL23P62829 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL23P62829 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL23P62829 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL23P62829 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL23P62829 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL23P62829 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL23P62829 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL23P62829 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL23P62829 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL23P62829 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL23P62829 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL23P62829 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL23P62829 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL23P62829 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL23P62829 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL23P62829 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL23P62829 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL23P62829 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RPL23P62829 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL23P62829 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL23P62829 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL23P62829 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL23P62829 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL23P62829 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL23P62829 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL23P62829 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL23P62829 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL23P62829 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL23P62829 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL23P62829 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL23P62829 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL23P62829 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL23P62829 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL23P62829 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL23P62829 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL23P62829 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL23P62829 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL23P62829 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL23P62829 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL23P62829 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL23P62829 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL23P62829 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL23P62829 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL23P62829 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL23P62829 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL23P62829 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL23P62829 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL23P62829 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL23P62829 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL23P62829 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL23P62829 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL23P62829 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL23P62829 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL23P62829 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RPL23P62829 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL23P62829 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL23P62829 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RPL23P62829 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms