Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVK-21P61565 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVK-21P61565 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVK-21P61565 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVK-21P61565 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVK-21P61565 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVK-21P61565 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVK-21P61565 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVK-21P61565 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ERVK-21P61565 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVK-21P61565 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVK-21P61565 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVK-21P61565 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVK-21P61565 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVK-21P61565 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVK-21P61565 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVK-21P61565 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVK-21P61565 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVK-21P61565 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVK-21P61565 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVK-21P61565 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVK-21P61565 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVK-21P61565 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVK-21P61565 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVK-21P61565 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ERVK-21P61565 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVK-21P61565 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVK-21P61565 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVK-21P61565 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVK-21P61565 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVK-21P61565 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVK-21P61565 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVK-21P61565 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVK-21P61565 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVK-21P61565 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVK-21P61565 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVK-21P61565 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVK-21P61565 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVK-21P61565 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVK-21P61565 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVK-21P61565 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ERVK-21P61565 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVK-21P61565 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVK-21P61565 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVK-21P61565 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVK-21P61565 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVK-21P61565 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVK-21P61565 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVK-21P61565 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVK-21P61565 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVK-21P61565 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVK-21P61565 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVK-21P61565 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVK-21P61565 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVK-21P61565 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVK-21P61565 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVK-21P61565 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ERVK-21P61565 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ERVK-21P61565 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ERVK-21P61565 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
ERVK-21P61565 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms