Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUP107P57740 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUP107P57740 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUP107P57740 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUP107P57740 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUP107P57740 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUP107P57740 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUP107P57740 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUP107P57740 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUP107P57740 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUP107P57740 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUP107P57740 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
NUP107P57740 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUP107P57740 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUP107P57740 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUP107P57740 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUP107P57740 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUP107P57740 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUP107P57740 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUP107P57740 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
NUP107P57740 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUP107P57740 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUP107P57740 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUP107P57740 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUP107P57740 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
NUP107P57740 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUP107P57740 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUP107P57740 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUP107P57740 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUP107P57740 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUP107P57740 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUP107P57740 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUP107P57740 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
NUP107P57740 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUP107P57740 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUP107P57740 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUP107P57740 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUP107P57740 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUP107P57740 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUP107P57740 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUP107P57740 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
NUP107P57740 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUP107P57740 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUP107P57740 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUP107P57740 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUP107P57740 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUP107P57740 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUP107P57740 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUP107P57740 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUP107P57740 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUP107P57740 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUP107P57740 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
NUP107P57740 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUP107P57740 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUP107P57740 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUP107P57740 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUP107P57740 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUP107P57740 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUP107P57740 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUP107P57740 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUP107P57740 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUP107P57740 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUP107P57740 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUP107P57740 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUP107P57740 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUP107P57740 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUP107P57740 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
NUP107P57740 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUP107P57740 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUP107P57740 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUP107P57740 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUP107P57740 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUP107P57740 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUP107P57740 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUP107P57740 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUP107P57740 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
NUP107P57740 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUP107P57740 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUP107P57740 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUP107P57740 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUP107P57740 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUP107P57740 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUP107P57740 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUP107P57740 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUP107P57740 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUP107P57740 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUP107P57740 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUP107P57740 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUP107P57740 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
NUP107P57740 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUP107P57740 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUP107P57740 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
NUP107P57740 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUP107P57740 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUP107P57740 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUP107P57740 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUP107P57740 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUP107P57740 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUP107P57740 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
NUP107P57740 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms