Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NME5P56597 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NME5P56597 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NME5P56597 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NME5P56597 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NME5P56597 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NME5P56597 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NME5P56597 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NME5P56597 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
NME5P56597 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NME5P56597 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NME5P56597 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NME5P56597 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
NME5P56597 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
NME5P56597 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NME5P56597 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NME5P56597 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NME5P56597 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NME5P56597 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NME5P56597 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NME5P56597 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NME5P56597 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NME5P56597 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NME5P56597 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NME5P56597 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NME5P56597 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NME5P56597 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NME5P56597 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NME5P56597 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NME5P56597 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NME5P56597 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NME5P56597 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NME5P56597 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NME5P56597 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NME5P56597 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NME5P56597 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NME5P56597 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NME5P56597 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NME5P56597 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NME5P56597 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NME5P56597 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
NME5P56597 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NME5P56597 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NME5P56597 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NME5P56597 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NME5P56597 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NME5P56597 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NME5P56597 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NME5P56597 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NME5P56597 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NME5P56597 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NME5P56597 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NME5P56597 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NME5P56597 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NME5P56597 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NME5P56597 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NME5P56597 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NME5P56597 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NME5P56597 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NME5P56597 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NME5P56597 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NME5P56597 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NME5P56597 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NME5P56597 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NME5P56597 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NME5P56597 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NME5P56597 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NME5P56597 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NME5P56597 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NME5P56597 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NME5P56597 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NME5P56597 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NME5P56597 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NME5P56597 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NME5P56597 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NME5P56597 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NME5P56597 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NME5P56597 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NME5P56597 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NME5P56597 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NME5P56597 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NME5P56597 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NME5P56597 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NME5P56597 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NME5P56597 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NME5P56597 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NME5P56597 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NME5P56597 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NME5P56597 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
NME5P56597 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NME5P56597 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NME5P56597 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NME5P56597 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NME5P56597 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NME5P56597 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NME5P56597 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NME5P56597 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NME5P56597 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NME5P56597 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NME5P56597 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms