Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
AFDNP55196 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AFDNP55196 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
AFDNP55196 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AFDNP55196 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
AFDNP55196 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
AFDNP55196 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
AFDNP55196 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AFDNP55196 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AFDNP55196 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AFDNP55196 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
AFDNP55196 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
AFDNP55196 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
AFDNP55196 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AFDNP55196 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
AFDNP55196 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
AFDNP55196 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AFDNP55196 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AFDNP55196 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AFDNP55196 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AFDNP55196 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
AFDNP55196 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
AFDNP55196 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
AFDNP55196 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
AFDNP55196 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
AFDNP55196 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
AFDNP55196 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
AFDNP55196 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
AFDNP55196 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
AFDNP55196 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
AFDNP55196 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
AFDNP55196 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
AFDNP55196 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
AFDNP55196 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
AFDNP55196 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
AFDNP55196 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
AFDNP55196 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
AFDNP55196 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
AFDNP55196 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
AFDNP55196 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AFDNP55196 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AFDNP55196 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
AFDNP55196 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
AFDNP55196 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
AFDNP55196 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
AFDNP55196 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
AFDNP55196 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AFDNP55196 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AFDNP55196 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
AFDNP55196 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AFDNP55196 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AFDNP55196 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AFDNP55196 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AFDNP55196 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
AFDNP55196 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
AFDNP55196 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
AFDNP55196 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
AFDNP55196 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
AFDNP55196 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AFDNP55196 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AFDNP55196 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AFDNP55196 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AFDNP55196 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AFDNP55196 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AFDNP55196 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AFDNP55196 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AFDNP55196 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
AFDNP55196 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
AFDNP55196 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
AFDNP55196 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
AFDNP55196 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
AFDNP55196 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AFDNP55196 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
AFDNP55196 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AFDNP55196 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AFDNP55196 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
AFDNP55196 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
AFDNP55196 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
AFDNP55196 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AFDNP55196 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
AFDNP55196 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AFDNP55196 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
AFDNP55196 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AFDNP55196 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
AFDNP55196 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AFDNP55196 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AFDNP55196 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AFDNP55196 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AFDNP55196 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
AFDNP55196 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
AFDNP55196 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
AFDNP55196 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
AFDNP55196 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
AFDNP55196 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AFDNP55196 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
AFDNP55196 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AFDNP55196 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
AFDNP55196 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AFDNP55196 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AFDNP55196 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms