Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RAD23AP54725 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
RAD23AP54725 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms