Protein–RNA interactions for Protein: P52952

NKX2-5, Homeobox protein Nkx-2.5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX2-5P52952 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NKX2-5P52952 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms