Protein–RNA interactions for Protein: P50549

ETV1, ETS translocation variant 1, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV1P50549 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
ETV1P50549 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ETV1P50549 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ETV1P50549 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ETV1P50549 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ETV1P50549 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
ETV1P50549 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
ETV1P50549 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ETV1P50549 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ETV1P50549 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ETV1P50549 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ETV1P50549 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ETV1P50549 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ETV1P50549 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ETV1P50549 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ETV1P50549 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ETV1P50549 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ETV1P50549 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
ETV1P50549 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
ETV1P50549 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ETV1P50549 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ETV1P50549 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ETV1P50549 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ETV1P50549 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ETV1P50549 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ETV1P50549 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ETV1P50549 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ETV1P50549 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ETV1P50549 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ETV1P50549 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ETV1P50549 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ETV1P50549 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ETV1P50549 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ETV1P50549 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ETV1P50549 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ETV1P50549 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ETV1P50549 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ETV1P50549 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ETV1P50549 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ETV1P50549 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ETV1P50549 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ETV1P50549 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ETV1P50549 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ETV1P50549 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ETV1P50549 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ETV1P50549 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ETV1P50549 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ETV1P50549 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ETV1P50549 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ETV1P50549 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
ETV1P50549 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ETV1P50549 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ETV1P50549 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
ETV1P50549 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
ETV1P50549 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ETV1P50549 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ETV1P50549 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ETV1P50549 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ETV1P50549 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ETV1P50549 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ETV1P50549 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ETV1P50549 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ETV1P50549 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ETV1P50549 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ETV1P50549 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ETV1P50549 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ETV1P50549 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ETV1P50549 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ETV1P50549 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ETV1P50549 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ETV1P50549 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ETV1P50549 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ETV1P50549 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ETV1P50549 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ETV1P50549 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ETV1P50549 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ETV1P50549 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ETV1P50549 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ETV1P50549 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ETV1P50549 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ETV1P50549 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ETV1P50549 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ETV1P50549 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ETV1P50549 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ETV1P50549 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ETV1P50549 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ETV1P50549 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ETV1P50549 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ETV1P50549 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ETV1P50549 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ETV1P50549 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ETV1P50549 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ETV1P50549 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ETV1P50549 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ETV1P50549 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ETV1P50549 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ETV1P50549 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ETV1P50549 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ETV1P50549 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ETV1P50549 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms