Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TAF6P49848 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TAF6P49848 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TAF6P49848 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TAF6P49848 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TAF6P49848 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TAF6P49848 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TAF6P49848 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TAF6P49848 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
TAF6P49848 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF6P49848 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF6P49848 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF6P49848 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF6P49848 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF6P49848 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF6P49848 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF6P49848 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF6P49848 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF6P49848 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF6P49848 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF6P49848 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF6P49848 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF6P49848 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF6P49848 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF6P49848 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF6P49848 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF6P49848 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF6P49848 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF6P49848 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF6P49848 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF6P49848 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF6P49848 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TAF6P49848 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF6P49848 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF6P49848 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF6P49848 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF6P49848 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF6P49848 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF6P49848 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF6P49848 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF6P49848 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF6P49848 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF6P49848 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF6P49848 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF6P49848 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF6P49848 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF6P49848 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF6P49848 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF6P49848 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF6P49848 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF6P49848 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TAF6P49848 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF6P49848 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF6P49848 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF6P49848 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF6P49848 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF6P49848 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF6P49848 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF6P49848 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF6P49848 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF6P49848 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF6P49848 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF6P49848 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF6P49848 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF6P49848 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF6P49848 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF6P49848 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF6P49848 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF6P49848 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF6P49848 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF6P49848 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF6P49848 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF6P49848 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF6P49848 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF6P49848 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF6P49848 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF6P49848 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF6P49848 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF6P49848 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TAF6P49848 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF6P49848 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF6P49848 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF6P49848 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF6P49848 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF6P49848 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF6P49848 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF6P49848 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF6P49848 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF6P49848 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF6P49848 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF6P49848 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF6P49848 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF6P49848 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF6P49848 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF6P49848 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF6P49848 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
TAF6P49848 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF6P49848 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF6P49848 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
TAF6P49848 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms