Protein–RNA interactions for Protein: P48729

CSNK1A1, Casein kinase I isoform alpha, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1A1P48729 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSNK1A1P48729 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSNK1A1P48729 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSNK1A1P48729 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSNK1A1P48729 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSNK1A1P48729 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CSNK1A1P48729 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CSNK1A1P48729 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CSNK1A1P48729 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSNK1A1P48729 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSNK1A1P48729 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSNK1A1P48729 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSNK1A1P48729 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSNK1A1P48729 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSNK1A1P48729 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSNK1A1P48729 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSNK1A1P48729 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSNK1A1P48729 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSNK1A1P48729 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSNK1A1P48729 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSNK1A1P48729 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CSNK1A1P48729 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSNK1A1P48729 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSNK1A1P48729 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CSNK1A1P48729 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CSNK1A1P48729 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSNK1A1P48729 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSNK1A1P48729 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSNK1A1P48729 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSNK1A1P48729 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSNK1A1P48729 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSNK1A1P48729 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CSNK1A1P48729 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSNK1A1P48729 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSNK1A1P48729 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSNK1A1P48729 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSNK1A1P48729 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSNK1A1P48729 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSNK1A1P48729 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSNK1A1P48729 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSNK1A1P48729 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSNK1A1P48729 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSNK1A1P48729 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CSNK1A1P48729 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CSNK1A1P48729 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CSNK1A1P48729 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSNK1A1P48729 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSNK1A1P48729 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSNK1A1P48729 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CSNK1A1P48729 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSNK1A1P48729 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSNK1A1P48729 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSNK1A1P48729 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSNK1A1P48729 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSNK1A1P48729 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSNK1A1P48729 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSNK1A1P48729 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSNK1A1P48729 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSNK1A1P48729 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSNK1A1P48729 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CSNK1A1P48729 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSNK1A1P48729 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CSNK1A1P48729 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CSNK1A1P48729 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSNK1A1P48729 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSNK1A1P48729 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSNK1A1P48729 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSNK1A1P48729 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSNK1A1P48729 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSNK1A1P48729 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSNK1A1P48729 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSNK1A1P48729 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CSNK1A1P48729 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSNK1A1P48729 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSNK1A1P48729 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSNK1A1P48729 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSNK1A1P48729 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSNK1A1P48729 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSNK1A1P48729 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSNK1A1P48729 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSNK1A1P48729 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSNK1A1P48729 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSNK1A1P48729 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSNK1A1P48729 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSNK1A1P48729 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CSNK1A1P48729 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSNK1A1P48729 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSNK1A1P48729 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSNK1A1P48729 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CSNK1A1P48729 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSNK1A1P48729 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSNK1A1P48729 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CSNK1A1P48729 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSNK1A1P48729 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSNK1A1P48729 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSNK1A1P48729 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CSNK1A1P48729 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSNK1A1P48729 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSNK1A1P48729 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CSNK1A1P48729 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms