Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GCLMP48507 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
GCLMP48507 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
GCLMP48507 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
GCLMP48507 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GCLMP48507 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GCLMP48507 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GCLMP48507 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GCLMP48507 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GCLMP48507 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GCLMP48507 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GCLMP48507 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GCLMP48507 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GCLMP48507 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GCLMP48507 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GCLMP48507 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GCLMP48507 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GCLMP48507 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GCLMP48507 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GCLMP48507 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GCLMP48507 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GCLMP48507 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GCLMP48507 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GCLMP48507 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GCLMP48507 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GCLMP48507 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GCLMP48507 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GCLMP48507 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GCLMP48507 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GCLMP48507 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GCLMP48507 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GCLMP48507 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GCLMP48507 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GCLMP48507 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GCLMP48507 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GCLMP48507 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GCLMP48507 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GCLMP48507 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GCLMP48507 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GCLMP48507 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GCLMP48507 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GCLMP48507 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GCLMP48507 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GCLMP48507 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GCLMP48507 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GCLMP48507 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GCLMP48507 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GCLMP48507 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GCLMP48507 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
GCLMP48507 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GCLMP48507 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GCLMP48507 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GCLMP48507 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GCLMP48507 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GCLMP48507 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GCLMP48507 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GCLMP48507 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GCLMP48507 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GCLMP48507 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GCLMP48507 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GCLMP48507 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GCLMP48507 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GCLMP48507 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GCLMP48507 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GCLMP48507 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GCLMP48507 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCLMP48507 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCLMP48507 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCLMP48507 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCLMP48507 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCLMP48507 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCLMP48507 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCLMP48507 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCLMP48507 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCLMP48507 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCLMP48507 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCLMP48507 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCLMP48507 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCLMP48507 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCLMP48507 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCLMP48507 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCLMP48507 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCLMP48507 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCLMP48507 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCLMP48507 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCLMP48507 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GCLMP48507 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GCLMP48507 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GCLMP48507 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GCLMP48507 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GCLMP48507 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GCLMP48507 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GCLMP48507 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GCLMP48507 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GCLMP48507 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GCLMP48507 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GCLMP48507 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GCLMP48507 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GCLMP48507 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GCLMP48507 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms