Protein–RNA interactions for Protein: P48304

REG1B, Lithostathine-1-beta, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REG1BP48304 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
REG1BP48304 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
REG1BP48304 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
REG1BP48304 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
REG1BP48304 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
REG1BP48304 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
REG1BP48304 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
REG1BP48304 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
REG1BP48304 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
REG1BP48304 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
REG1BP48304 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
REG1BP48304 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
REG1BP48304 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
REG1BP48304 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
REG1BP48304 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
REG1BP48304 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
REG1BP48304 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
REG1BP48304 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
REG1BP48304 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
REG1BP48304 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
REG1BP48304 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
REG1BP48304 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
REG1BP48304 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
REG1BP48304 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
REG1BP48304 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
REG1BP48304 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
REG1BP48304 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
REG1BP48304 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
REG1BP48304 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
REG1BP48304 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
REG1BP48304 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
REG1BP48304 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
REG1BP48304 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
REG1BP48304 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
REG1BP48304 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
REG1BP48304 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
REG1BP48304 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
REG1BP48304 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
REG1BP48304 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
REG1BP48304 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
REG1BP48304 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
REG1BP48304 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
REG1BP48304 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
REG1BP48304 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
REG1BP48304 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
REG1BP48304 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
REG1BP48304 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
REG1BP48304 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
REG1BP48304 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
REG1BP48304 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
REG1BP48304 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
REG1BP48304 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
REG1BP48304 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
REG1BP48304 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
REG1BP48304 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
REG1BP48304 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
REG1BP48304 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
REG1BP48304 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
REG1BP48304 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
REG1BP48304 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
REG1BP48304 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
REG1BP48304 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
REG1BP48304 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
REG1BP48304 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
REG1BP48304 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
REG1BP48304 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
REG1BP48304 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
REG1BP48304 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
REG1BP48304 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
REG1BP48304 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
REG1BP48304 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
REG1BP48304 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
REG1BP48304 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
REG1BP48304 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
REG1BP48304 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
REG1BP48304 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
REG1BP48304 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
REG1BP48304 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
REG1BP48304 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
REG1BP48304 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
REG1BP48304 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
REG1BP48304 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
REG1BP48304 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
REG1BP48304 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
REG1BP48304 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
REG1BP48304 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
REG1BP48304 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
REG1BP48304 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
REG1BP48304 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
REG1BP48304 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
REG1BP48304 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
REG1BP48304 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
REG1BP48304 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
REG1BP48304 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
REG1BP48304 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
REG1BP48304 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
REG1BP48304 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
REG1BP48304 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
REG1BP48304 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
REG1BP48304 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms