Protein–RNA interactions for Protein: P48058

GRIA4, Glutamate receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA4P48058 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GRIA4P48058 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GRIA4P48058 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GRIA4P48058 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GRIA4P48058 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GRIA4P48058 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GRIA4P48058 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GRIA4P48058 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GRIA4P48058 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIA4P48058 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIA4P48058 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIA4P48058 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIA4P48058 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIA4P48058 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIA4P48058 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIA4P48058 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIA4P48058 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIA4P48058 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIA4P48058 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIA4P48058 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIA4P48058 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GRIA4P48058 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIA4P48058 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIA4P48058 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIA4P48058 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIA4P48058 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIA4P48058 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIA4P48058 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIA4P48058 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIA4P48058 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIA4P48058 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GRIA4P48058 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms