Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UTRNP46939 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UTRNP46939 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
UTRNP46939 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
UTRNP46939 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
UTRNP46939 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
UTRNP46939 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UTRNP46939 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
UTRNP46939 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
UTRNP46939 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
UTRNP46939 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
UTRNP46939 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
UTRNP46939 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
UTRNP46939 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UTRNP46939 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UTRNP46939 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UTRNP46939 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
UTRNP46939 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
UTRNP46939 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
UTRNP46939 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
UTRNP46939 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
UTRNP46939 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UTRNP46939 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UTRNP46939 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
UTRNP46939 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UTRNP46939 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UTRNP46939 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UTRNP46939 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
UTRNP46939 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UTRNP46939 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UTRNP46939 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UTRNP46939 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UTRNP46939 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UTRNP46939 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UTRNP46939 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UTRNP46939 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UTRNP46939 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UTRNP46939 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UTRNP46939 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UTRNP46939 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UTRNP46939 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UTRNP46939 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UTRNP46939 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UTRNP46939 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UTRNP46939 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UTRNP46939 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
UTRNP46939 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UTRNP46939 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UTRNP46939 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UTRNP46939 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UTRNP46939 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UTRNP46939 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
UTRNP46939 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UTRNP46939 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UTRNP46939 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UTRNP46939 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UTRNP46939 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UTRNP46939 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UTRNP46939 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UTRNP46939 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UTRNP46939 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UTRNP46939 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UTRNP46939 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
UTRNP46939 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UTRNP46939 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UTRNP46939 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UTRNP46939 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UTRNP46939 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UTRNP46939 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UTRNP46939 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UTRNP46939 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UTRNP46939 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
UTRNP46939 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UTRNP46939 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UTRNP46939 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UTRNP46939 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UTRNP46939 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UTRNP46939 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UTRNP46939 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UTRNP46939 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
UTRNP46939 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UTRNP46939 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UTRNP46939 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UTRNP46939 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UTRNP46939 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UTRNP46939 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UTRNP46939 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UTRNP46939 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UTRNP46939 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UTRNP46939 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UTRNP46939 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UTRNP46939 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
UTRNP46939 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UTRNP46939 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UTRNP46939 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UTRNP46939 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UTRNP46939 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UTRNP46939 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UTRNP46939 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
UTRNP46939 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms