Protein–RNA interactions for Protein: P46109

CRKL, Crk-like protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRKLP46109 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRKLP46109 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRKLP46109 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRKLP46109 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRKLP46109 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRKLP46109 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CRKLP46109 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRKLP46109 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRKLP46109 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRKLP46109 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CRKLP46109 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRKLP46109 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRKLP46109 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRKLP46109 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRKLP46109 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRKLP46109 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRKLP46109 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CRKLP46109 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRKLP46109 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRKLP46109 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRKLP46109 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRKLP46109 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRKLP46109 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRKLP46109 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRKLP46109 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRKLP46109 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CRKLP46109 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRKLP46109 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRKLP46109 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRKLP46109 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRKLP46109 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRKLP46109 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRKLP46109 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRKLP46109 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CRKLP46109 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRKLP46109 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRKLP46109 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRKLP46109 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRKLP46109 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRKLP46109 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRKLP46109 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CRKLP46109 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CRKLP46109 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CRKLP46109 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRKLP46109 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CRKLP46109 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRKLP46109 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CRKLP46109 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRKLP46109 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CRKLP46109 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CRKLP46109 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CRKLP46109 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CRKLP46109 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CRKLP46109 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CRKLP46109 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CRKLP46109 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CRKLP46109 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CRKLP46109 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CRKLP46109 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CRKLP46109 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CRKLP46109 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CRKLP46109 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CRKLP46109 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CRKLP46109 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CRKLP46109 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CRKLP46109 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRKLP46109 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRKLP46109 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRKLP46109 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CRKLP46109 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRKLP46109 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRKLP46109 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRKLP46109 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRKLP46109 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRKLP46109 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRKLP46109 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRKLP46109 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRKLP46109 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRKLP46109 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRKLP46109 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRKLP46109 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRKLP46109 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRKLP46109 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRKLP46109 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRKLP46109 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRKLP46109 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRKLP46109 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CRKLP46109 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRKLP46109 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRKLP46109 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRKLP46109 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRKLP46109 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CRKLP46109 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRKLP46109 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRKLP46109 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRKLP46109 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRKLP46109 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRKLP46109 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRKLP46109 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CRKLP46109 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms