Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRIM23P36406 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRIM23P36406 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms