Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
DDIT3P35638 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
DDIT3P35638 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms