Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COPB2P35606 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COPB2P35606 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COPB2P35606 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COPB2P35606 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
COPB2P35606 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COPB2P35606 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COPB2P35606 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
COPB2P35606 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COPB2P35606 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COPB2P35606 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
COPB2P35606 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPB2P35606 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPB2P35606 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPB2P35606 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPB2P35606 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPB2P35606 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPB2P35606 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPB2P35606 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPB2P35606 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPB2P35606 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPB2P35606 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPB2P35606 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPB2P35606 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPB2P35606 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPB2P35606 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPB2P35606 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPB2P35606 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPB2P35606 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COPB2P35606 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COPB2P35606 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COPB2P35606 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COPB2P35606 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COPB2P35606 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
COPB2P35606 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
COPB2P35606 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COPB2P35606 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COPB2P35606 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
COPB2P35606 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COPB2P35606 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COPB2P35606 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COPB2P35606 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COPB2P35606 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COPB2P35606 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COPB2P35606 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COPB2P35606 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COPB2P35606 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
COPB2P35606 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
COPB2P35606 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPB2P35606 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPB2P35606 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPB2P35606 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
COPB2P35606 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPB2P35606 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPB2P35606 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPB2P35606 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPB2P35606 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPB2P35606 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPB2P35606 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPB2P35606 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPB2P35606 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPB2P35606 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
COPB2P35606 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPB2P35606 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPB2P35606 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPB2P35606 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPB2P35606 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPB2P35606 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPB2P35606 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPB2P35606 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
COPB2P35606 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPB2P35606 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COPB2P35606 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPB2P35606 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
COPB2P35606 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPB2P35606 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPB2P35606 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPB2P35606 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPB2P35606 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPB2P35606 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPB2P35606 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPB2P35606 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
COPB2P35606 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPB2P35606 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPB2P35606 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPB2P35606 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPB2P35606 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPB2P35606 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPB2P35606 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COPB2P35606 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPB2P35606 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPB2P35606 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPB2P35606 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPB2P35606 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPB2P35606 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPB2P35606 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPB2P35606 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPB2P35606 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPB2P35606 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
COPB2P35606 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms