Protein–RNA interactions for Protein: P31941

APOBEC3A, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3AP31941 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
APOBEC3AP31941 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
APOBEC3AP31941 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
APOBEC3AP31941 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
APOBEC3AP31941 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms