Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CASP1P29466 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASP1P29466 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASP1P29466 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASP1P29466 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASP1P29466 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASP1P29466 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASP1P29466 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASP1P29466 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASP1P29466 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASP1P29466 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CASP1P29466 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASP1P29466 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CASP1P29466 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASP1P29466 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASP1P29466 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASP1P29466 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASP1P29466 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASP1P29466 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASP1P29466 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASP1P29466 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASP1P29466 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASP1P29466 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASP1P29466 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASP1P29466 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASP1P29466 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CASP1P29466 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASP1P29466 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASP1P29466 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASP1P29466 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASP1P29466 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASP1P29466 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASP1P29466 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASP1P29466 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASP1P29466 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CASP1P29466 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CASP1P29466 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CASP1P29466 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASP1P29466 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASP1P29466 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASP1P29466 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASP1P29466 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASP1P29466 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CASP1P29466 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASP1P29466 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASP1P29466 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASP1P29466 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASP1P29466 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASP1P29466 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASP1P29466 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASP1P29466 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASP1P29466 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASP1P29466 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASP1P29466 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASP1P29466 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASP1P29466 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CASP1P29466 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CASP1P29466 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASP1P29466 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASP1P29466 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASP1P29466 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASP1P29466 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CASP1P29466 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASP1P29466 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASP1P29466 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CASP1P29466 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP1P29466 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP1P29466 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP1P29466 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP1P29466 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP1P29466 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP1P29466 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP1P29466 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP1P29466 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP1P29466 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP1P29466 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP1P29466 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP1P29466 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP1P29466 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP1P29466 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP1P29466 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP1P29466 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP1P29466 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP1P29466 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP1P29466 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP1P29466 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP1P29466 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP1P29466 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CASP1P29466 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASP1P29466 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASP1P29466 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASP1P29466 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASP1P29466 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASP1P29466 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASP1P29466 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CASP1P29466 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASP1P29466 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASP1P29466 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASP1P29466 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CASP1P29466 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms