Protein–RNA interactions for Protein: P27448

MARK3, MAP/microtubule affinity-regulating kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARK3P27448 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MARK3P27448 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MARK3P27448 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MARK3P27448 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MARK3P27448 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MARK3P27448 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MARK3P27448 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MARK3P27448 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MARK3P27448 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MARK3P27448 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MARK3P27448 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MARK3P27448 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MARK3P27448 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MARK3P27448 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MARK3P27448 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MARK3P27448 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MARK3P27448 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MARK3P27448 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MARK3P27448 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MARK3P27448 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MARK3P27448 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MARK3P27448 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MARK3P27448 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MARK3P27448 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MARK3P27448 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MARK3P27448 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MARK3P27448 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MARK3P27448 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MARK3P27448 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MARK3P27448 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MARK3P27448 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MARK3P27448 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MARK3P27448 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
MARK3P27448 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MARK3P27448 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MARK3P27448 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MARK3P27448 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MARK3P27448 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MARK3P27448 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MARK3P27448 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MARK3P27448 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MARK3P27448 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MARK3P27448 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MARK3P27448 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MARK3P27448 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MARK3P27448 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MARK3P27448 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MARK3P27448 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MARK3P27448 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MARK3P27448 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
MARK3P27448 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MARK3P27448 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MARK3P27448 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MARK3P27448 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MARK3P27448 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MARK3P27448 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MARK3P27448 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MARK3P27448 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MARK3P27448 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MARK3P27448 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MARK3P27448 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MARK3P27448 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MARK3P27448 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MARK3P27448 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MARK3P27448 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MARK3P27448 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MARK3P27448 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MARK3P27448 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MARK3P27448 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MARK3P27448 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MARK3P27448 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MARK3P27448 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MARK3P27448 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MARK3P27448 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MARK3P27448 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MARK3P27448 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MARK3P27448 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MARK3P27448 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MARK3P27448 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MARK3P27448 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MARK3P27448 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MARK3P27448 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MARK3P27448 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MARK3P27448 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MARK3P27448 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MARK3P27448 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MARK3P27448 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MARK3P27448 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MARK3P27448 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MARK3P27448 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
MARK3P27448 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MARK3P27448 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MARK3P27448 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MARK3P27448 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MARK3P27448 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MARK3P27448 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MARK3P27448 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MARK3P27448 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
MARK3P27448 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MARK3P27448 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms