Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PTGS1P23219 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms